El primer projecte que farem serà sobre plantes medicinals i Medicaments o complements amb l'objectiu de crear dues taula interactiva que contingui informació fiable sobre medicaments, i un altre taula de plantes que siguin complements alimentaris, a base de plantes utilitzant fonts d'informació confiables. Hem après que els medicaments a base e plantes tenen indicacions terapeutiques, es a dir, s'ha demostrat que serveixen en estudis clínics amb pacients. En canvi, els complements alimenticis no tenen indicacions terapeutiques i no es poden utilitzar per tractar cap malaltia i alguns si que tenen alguns complements propietats saludables escrites al envàs. Per acabar, no s'han de confondre amb els medicaments homeopatics que contenen plantes, no tenen cap indicació terapeutica i així consta en el prospecte. Aquest cas és oscillococcinum.
Els projectes que farem seran:
Plantes medicinals i medicaments
Mapa d'imatges
Circuit de F1
Calendari amb fets històrics
PROJECTE: RECERCA DE NOUS FÀRMACS PER ORDINADOR
Pujar arxius amb el vostre fàrmac, els 6 ginkgòlids i la vostra proteïna a http://swissdock.ch/docking# recordeu la proteina en format pdb i els fàrmacs o ginkgolids en format mol2 (ginkgòlids en mol2 annexes). Recorda que pots preparar els productes amb Avogadro, Chimera, ChimeraX amb DockPrep, Add H, Add 3D i "sdf convert to mol2 online" o "mol convert to mol2.online"
Baixar per cada docking 3 resultats del mail de swissdock que caduquen en 7 dies: arxiu csv, arxiu zip i arxiu openchimera i guardar els 3 arxius en una carpeta amb el nom de la proteina i el nom de cada producte per exemple en una carpeta CodiPDB_NomFarmac com 1EEA_GinkgolideB
Pujar tots els csv obtinguts de swissdock per obtenir els resultats finals per obtenir gràfics i saber si els ginkgòlids tenen activitat semblant al vostre fàrmac https://colab.research.google.com/github/drfperez/DeepPurpose/blob/main/SwissdockAnalysisOK.ipynb
Treure conclusions dels gràfics obtinguts amb el codi del professor de la vostra proteina diana i el vostre fàrmacs de referència i posar les imatges obtingudes dels gràfics en la vostra web de neocities responent a moltes preguntes Per quina malaltia i per quin mecanisme la unió del fàrmac a la proteïna té un efecte terapèutic? Els ginkgòlids provats tenen activitat in silico (docking molecular) en el vostre model? Quin compost és més actiu? Després de la recerca in silico que heu fet en que consisteix la recerca in vitro, in vivo i estudis clínics?
